朱由校的想法在大多数的武将眼里都属于匪夷所思的, 但他们拘与对皇权、对天子的根深蒂固、有生而来的畏惧和敬仰，很快就接受了天子是为黄河下游百姓着想、宁可放弃后套这大好的耕田、继而还要放弃河套这能够让三边自给自足的肥沃良田。
啧啧有声的惋惜言论，落在了从固原赶过来的三边总督李起元耳朵里。
李起元对武将的论调概是嗤之以鼻。这些武将就是读书太少了, 什么事儿都等着文臣灌现成的给他们，也难怪熊廷弼不给他们好脸子。
哼, 天子是想减少往河套去的黄河水, 而不是把黄河截流了。等乌兰布和沙漠和库布齐沙漠变绿洲以后，前套也罢、后套也罢, 还会部分耕种的。就是毛乌素沙地要是经过十年、二十年的植树造林, 恢复秦汉时期的森林模样, 黄河南岸那一片也会耕种的。
“陛下，依臣陋见，不如往后套迁徙部分陕西的百姓来耕种了。这些百姓应纳的赋税，就用来做毛乌素沙漠植树、咳咳，就是陛下所说的绿化的花费。让黄河北边沿岸这里先数目成林, 然后就可以把后套收到的税赋, 用去南岸的植树。”
“时间呢？如果要花费十年以上的时间，怕是下游的治河费用会拖垮朝廷的。你知道内库从‘三大征’之后就靠着矿税往里填补一点银子, 萨尔浒前后往辽东投的那几百万, 是彻底淘空了内库的。”
接着朱由校又补充了一句，“朝廷的收入有限, 预算的压力太大了。”
李起元想想说道：“三边将士今年的粮饷提前足额发放了, 秋收的时候, 臣就可以将部分秋税移过来补充黄河这两块沙漠的植树开销。有三边今年这百万两粮饷的银子做周转, 臣可以在五年内在乌兰布和沙漠和库布齐沙漠种满树苗。”
两块沙漠的绿化是为了子孙后辈的百年大计，李起元决定豁出去了，就耗在三边做总督了。
朱由校咧嘴做了一个苦笑的表情，“看来那百万两白银，朕是拿不回手里了。”
李起元笑着安慰年前的少年。
“陛下放心，户部会给陛下大婚银子的。再说了，就是那笔银子进了内库，以后也还是会花在治理黄河、淮河、运河以及赈灾上，不如臣替陛下在上游把黄河治理清澈了，连渭河的北岸、还有泾水也按照陛下所想，陆续绿化固定了陕西的水土，千载之后也是咱君臣的佳话。”
朱由校心里认同李起元的想法，这事就得三边总督扛起来，承担全部的协调工作。难得现任总督积极主动想承担、做好这件事儿。
于是他郑重地对李起元说：“若李卿在五年内完成第一步，朕以世袭伯爵酬卿。若是李卿能在十年内彻底解决黄河水患，朕就以世袭侯爵相酬谢了。”
李起元大喜，躬身向天子保证，“臣将竭尽毕生之力完成此事。”
文官拜相难，封爵更是凤毛麟角了。更何况是凭借治理黄河得来的世袭爵位，大禹治水的美名，可是流传了千古呢。
读书为的不就是封妻荫子的千秋功名吗？！
有人肯做且是积极主动要求承担这样艰难的重任，朱由校便与李起元秉烛夜谈。君臣细细讨论治理河套沙漠还有渭河、泾河的疑难点，等到天光大明的时候，李起元已经在心里拟好了具体的行动步骤。
他这些年的游宦经历，促使他行事更有决断的魄力，这魄力也是建立在思考问题更周密更细致的基础上。他当着天子的面，把君臣一夜详谈归纳为可施行的方案。
当他落下最后一笔，轻吹墨迹的时候，脸上是由衷的自信微笑。
“陛下，此奏章大多是陛下的心血，臣就等内阁批转回来就着手去做了。”
朱由校虽熬了一夜但精神头非常好。
“如此，大明能够再继续两百年的功勋，应有李卿的一半。”
李起元一愣，他没想到天子会把黄河的治理看得这么重，但他立即向朱由校保证。
“陛下，臣回固原就立即着手做先期的准备，一定会在五年内，让陛下见到初效的。”
翌日，朱由校带着亲卫送李起元离开行营。
李起元对天子进谏道：“陛下也该早日返京了。春闱虽延期了一个月，但是殿试还等着陛下主持呢。”
朱由校点头：“朕就等着鞑靼大军到了以后，给他们一个教训就返回京师。”
李起元对好战的少年天子也没再进行更多的劝阻了，他知道自己说了也是没有用的。因为他知道凭借蹬口这里聚集的六万多禁军，还有宁夏卫、羽林卫的兵马，近十万的人马集合在这里，还有朝廷运来的新式火炮、炮弹，天子要是没能在这里与鞑靼来一场大战是不会甘心的。
他是一点儿也不担心天子会战败的。只一心盼着天子能够一次与鞑靼打过瘾了，再没有来西北的念头。他只一心盼着鞑靼大军早点到，早点打完也好让天子放心返回京师。
李起元还没有到宁夏镇呢，鞑靼的十几万大军就到了蹬口。李起元在宁夏镇得到消息的时候，对已经回到宁夏镇的马世龙说：“吴尽忠最担心的就是宁夏镇的那些回族等人闹事儿。蹬口那里已经开战了，宁夏镇这里就必须要稳定。天子在西北，可不能给天子一个咱们不能稳定三边的坏印象。你是回族，你出面去处理你那些族人闹事儿最适合了。”
马世龙对自己没能再跟随天子作战，懊丧得像死了亲爹。从他回到宁夏镇，宁夏的回回们听说他执掌宁夏镇立即都老实了八成。因为这家伙太心狠手黑了。另外还因为马世龙的威望高，想煽动回回们做对，一般都没人敢应。
现在三边总督对自己寄予厚望，他立即应命。
“李大人放心，有下官坐镇宁夏，谁敢炸翅，下官会令他后悔为人的。”
李起元在宁夏镇停留了十日，等到了天子大胜的消息。得知了部分将领率军追赶鞑靼败军、追出去有五百里远，然后乘东南风起来的时候，一边放火烧草原，一边慢慢引军退回了蹬口。
还等到吴尽忠、尤家兄弟带军回到宁夏镇，得知贺兰山的大大小小三十六个山口、阴山的北面等都实行了烧荒五百里的行动。
得知天子带军从黄河的前套去大同、然后返回京师的消息。
得知了鞑靼在蹬口的具体损失，李起元明白天子以自身为饵的一战，将护佑三边起码在三五年内是太太平平的，不会再受到来自北边的威胁了。
大捷的消息先天子一步送回到京师。京师沸腾的同时，朝廷也收到了四川左布政使朱燮元的急报。
永宁彝族土司奢崇明起兵叛乱，分四路进攻四川各地。在历史上，奢崇明利用大明在辽东屡屡战败之际起兵，想乘着大明辽东不安、西北受地，效法汉高祖旧事。
但是现在大明天启帝换人了，辽东战事也取得了压倒性的胜利，可是奢崇明准备了数年的反叛，在得知天子西北出征三个多月，还没有定下归期时候，认为朱由校一定是重蹈了朱家皇帝被俘虏的旧事、误以为天子将难以回到京师，悍然令其妹婿樊龙和部将刘彤率领两万的步骑兵去重庆。
重庆巡抚许可求不准许奢崇明的妹婿樊龙、部将张彤带军进重庆。言没有军部调兵的指令，奢崇明次行为涉嫌造/反，将其拒之在重庆的城门外。
樊龙、张彤立即开始攻打重庆。不果，掉头攻下合江、泸州、播州，遵义，而奢崇明一边围攻成都府，一边着手建立“大梁”国，设丞相以及五府官员等，整个蜀地震动，陷入慌乱之中。
兵部尚书崔景荣接到这样的八百里急报，快步到内阁与几位阁臣商量。
“陛下已经在回京的途中，此事要不要告知？”
叶向高立即明白了崔景荣的意思，他是怕天子从山西直接入川平叛。
刘一燝已经顺利完成杭州城的改造回到了京师，他和韩爌、叶向高、崔景荣都立即看向了方从哲。
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李起元1559年出生，1586进士，1629年辞世。
历经嘉靖、隆庆、万历、泰昌、天启、崇祯六朝，先后任职知县、主事、参议、副使、参政、布政、布政使、巡抚、总督、南北两京户部尚书。都察院左副都御史、右都御史、兵部右侍郎、左侍郎、太子太保、太子太傅。
李起元在管理户部后，遵旨会议事该署部事左侍郎陈所学等扵五二月二十日，题为恭陈饷额出入亏欠之数及臣部转输接济之艰，仰祈圣明珍念严勅省直抚按督征，并差部官分道守催。召开九卿十三科道会议，对天启朝财政混乱，税贼拖欠严重与税收不情理，作出了十三项改革措施。
现存李起元所撰《计部奏疏》十卷:(16开精装全三册)全国图书馆文献缩微复制中心出版。图书详描述:
《计部奏疏》十卷，明李起元撰。李起元曾官三边总督。天启时的明朝已内外交困，北有满兵，南部云贵川也不安宁，财力枯竭，他向皇上表示，宁愿留在南京任留都的户部尚书，请另物色更合适的人选。皇帝不准辞，他于五年二月到任。所上第一篇疏即《辽饷中断，万分可虞疏》。李启元在户部尚书在这个管理全国钱粮军饷的要害职位上很为难，书中各篇奏议大多是为钱粮短缺而楸心、叫苦的。此书祥细记录了明末天启五、六两年间的全国经济生活状况，是研究这一时期政治、经济、赋税、盐课、军事、评判史，以及王朝如何走向衰败、灭亡历史的重大数据库。
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历史上
天启元年(1621)，后金崛起于辽东，明军屡败，为解燃眉之急，明廷征调奢崇明率所部兵马援救辽东，奢崇明趁机派遣其婿樊龙、部将张彤率领步骑兵二万来到重庆。1621年9月17日，趁校场演武之机，杀死巡抚徐可求等军政官员20余人，发动叛乱，占据重庆，攻合江，破泸州，陷遵义(今属贵州省)，建国号"大梁"，设丞相、五府等官，全蜀震动。
奢崇明的叛乱，其党樊龙占据重庆达九个月，为其声援。重庆地势险要，三面临江，其出入必经要道惟佛图关至二郎关一路。樊龙自通远门城壕至二郎关连营十七，宿精兵数万。天启二年五月，朱燮元督秦良玉等夺二郎关，总兵官杜文焕破佛图关，乘胜进逼重庆。二十七日，燮元以计擒杀樊龙，生擒龙子友邦及其党三十余人，遂收复重庆。
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